Detección de Clavibacter michiganensis mediante qPCR
LoopSense™ Q Cmm es un kit molecular diseñado para la detección cualitativa de Clavibacter michiganensis, bacteria asociada al cáncer bacteriano del tomate.
El producto utiliza PCR en tiempo real mediante una sonda fluorescente específica. Al tratarse de un objetivo bacteriano basado en ADN, el ensayo no requiere una etapa previa de retrotranscripción.
Los reactivos específicos se suministran en formato liofilizado para facilitar su preparación, reducir la manipulación y favorecer su integración en análisis rutinarios y proyectos de investigación.
Características principales
- Detección cualitativa de Clavibacter michiganensis.
- Tecnología qPCR en tiempo real.
- Detección directa de ADN bacteriano.
- Sin etapa de retrotranscripción.
- Lectura de fluorescencia en el canal FAM.
- Reactivos específicos en formato liofilizado.
- Compatible con termocicladores qPCR de plataforma abierta.
- Aplicable a extractos de muestras vegetales.
- Disponible en diferentes formatos de reacciones.
- Uso exclusivo para investigación.
Uso previsto
LoopSense™ Q Cmm está destinado a la detección cualitativa de ADN de Clavibacter michiganensis en extractos procedentes de material vegetal y otras matrices evaluadas por el laboratorio.
El kit puede integrarse en:
- Programas de investigación en bacteriología vegetal.
- Análisis de plantas con síntomas compatibles.
- Evaluación de material vegetal aparentemente asintomático.
- Control de plantas madre, semilleros y material de propagación.
- Estudios de presencia y distribución del patógeno.
- Programas internos de vigilancia fitosanitaria.
Tipos de muestra
El ensayo está destinado al análisis de ADN previamente extraído de material vegetal. Las matrices pueden incluir hojas, tallos, pecíolos, plántulas, tejido vascular y otros materiales definidos por el laboratorio.
El kit de extracción de ácidos nucleicos no está incluido y debe seleccionarse de acuerdo con la matriz, el tipo de muestra y el flujo de trabajo utilizado.
Preparación de las muestras
El ADN utilizado debe presentar una calidad y pureza compatibles con la amplificación mediante qPCR.
La eficacia del análisis depende de varios factores:
- La representatividad de la muestra analizada.
- La eficacia del procedimiento de extracción.
- La concentración y calidad del ADN obtenido.
- La ausencia de inhibidores de la amplificación.
- El empleo de controles positivos y negativos adecuados.
- El cumplimiento de las condiciones establecidas en el IFU.
Tecnología qPCR
La detección se realiza mediante amplificación por PCR en tiempo real y una sonda fluorescente específica para el objetivo.
La señal de amplificación se registra en el canal FAM. Al detectarse directamente ADN bacteriano, el protocolo no incluye una etapa de transcripción inversa.
Presentación del producto
LoopSense™ Q Cmm contiene reactivos específicos liofilizados para la amplificación y detección del objetivo.
El número de determinaciones, controles y componentes incluidos depende del formato seleccionado.
El formato liofilizado facilita la preparación de la reacción, reduce el número de manipulaciones y contribuye a la estandarización del flujo de trabajo.
Compatibilidad
El kit puede utilizarse en termocicladores de PCR en tiempo real de plataforma abierta que cumplan los siguientes requisitos:
- Compatibilidad con el canal FAM.
- Posibilidad de configurar el programa térmico especificado.
- Compatibilidad con el volumen de reacción indicado.
- Compatibilidad con el tipo de tubo, placa o consumible utilizado.
Interpretación de resultados
La presencia o ausencia del objetivo debe evaluarse mediante el análisis de las curvas de amplificación y la comparación con los controles incluidos en el ensayo.
La interpretación debe considerar:
- La amplificación correcta del control positivo.
- La ausencia de señal específica en el control negativo.
- La forma y consistencia de la curva de amplificación de la muestra.
- El valor de Cq obtenido.
- Los criterios de aceptación definidos por el laboratorio.
- Las instrucciones y límites establecidos en el IFU.
Un resultado debe considerarse válido únicamente cuando los controles del ensayo cumplen los criterios de aceptación establecidos.
Consideraciones sobre la nomenclatura
En documentación técnica, protocolos y publicaciones científicas también puede encontrarse la denominación histórica Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis.
El acrónimo Cmm continúa utilizándose de forma habitual para identificar al agente asociado al cáncer bacteriano del tomate. La inclusión de ambas denominaciones facilita la localización del producto en búsquedas técnicas y bibliográficas.
Producto destinado exclusivamente a investigación — Research Use Only (RUO). No destinado a diagnóstico clínico.
Documentación técnica
Consulta las instrucciones de uso para conocer la preparación de la reacción, el programa térmico, los controles y los criterios de interpretación.
Preguntas frecuentes
¿LoopSense™ Q Cmm utiliza RT-qPCR?
No. Clavibacter michiganensis es una bacteria y el ensayo detecta directamente ADN mediante qPCR. Por tanto, no requiere una etapa de retrotranscripción.
¿Qué enfermedad se asocia con Cmm?
Clavibacter michiganensis se relaciona con el cáncer bacteriano del tomate, una enfermedad que puede afectar diferentes órganos de la planta.
¿Qué canal de fluorescencia utiliza?
La fluorescencia correspondiente al objetivo se registra en el canal FAM.
¿El kit incluye el sistema de extracción?
No. El ADN debe extraerse previamente mediante un procedimiento adecuado para la matriz vegetal analizada.
¿Puede utilizarse en cualquier termociclador?
Puede utilizarse en equipos qPCR de plataforma abierta compatibles con el canal FAM, el volumen de reacción, el consumible y el programa térmico indicados en las instrucciones de uso.
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